傳染病檢測(cè)有兩種方式：檢測(cè)病原體或者檢測(cè)人體為了抵抗病原體而產(chǎn)生的抗體。其中病原體檢測(cè)可通過(guò)抗原檢測(cè)或者核酸檢測(cè)方法進(jìn)行，在COVID-19全球范圍內(nèi)爆發(fā)傳播后，基于分子水平的核酸檢測(cè)技術(shù)逐漸成為病原體檢測(cè)的重要手段。目前，用于病原體檢測(cè)的主流技術(shù)有哪些？一起來(lái)看看！

熒光定量RT-PCR技術(shù)

熒光定量RT-PCR技術(shù)是將提取出的病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA，然后對(duì)合成的cDNA進(jìn)行擴(kuò)增，再利用熒光探針檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物，通過(guò)擴(kuò)增產(chǎn)物中的熒光信號(hào)來(lái)判斷樣本中是否含有病毒序列。熒光定量RT-PCR技術(shù)是世界各國(guó)疾控中心（CDC）采用的金標(biāo)準(zhǔn)，可以檢測(cè)患者樣本中微小病原體，是傳染病病毒傳播早期診斷的主要方法。

圖1 RT-PCR檢測(cè)流程圖

逆轉(zhuǎn)錄等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)

逆轉(zhuǎn)錄等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)是在恒定溫度下，通過(guò)添加不同活性的酶和各自特異性的引物來(lái)達(dá)到快速擴(kuò)增核酸的目的。等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)近年來(lái)發(fā)展迅速，擺脫了對(duì)熱循環(huán)儀的依賴(lài)，在現(xiàn)場(chǎng)診斷方面顯示出較強(qiáng)的優(yōu)越性。目前主流的技術(shù)有環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增（Loop-mediated isothermal amplication，LAMP）、連置換擴(kuò)增（strand displacement amplification，SDA）、滾環(huán)核酸擴(kuò)增技術(shù)（rolling cricle amplification）、依賴(lài)核酸序列擴(kuò)增技術(shù)（nucleicacid sequence-based amplification，NASBA）。LAMP具有高度特異性，識(shí)別DNA/RNA靶標(biāo)特定位置可高達(dá)8個(gè)，也被稱(chēng)為“八倍鏡”，它是眾多等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)中研究和應(yīng)用較為成熟的，在及時(shí)檢測(cè)POCT（Point of Care Testing）中發(fā)揮重大作用。NASBA是一種簡(jiǎn)單的等溫信號(hào)放大法，在監(jiān)測(cè)和控制動(dòng)物疾病傳播方面廣泛應(yīng)用。

圖2 依賴(lài)核酸序列擴(kuò)增技術(shù)（NASBA）檢測(cè)SARS-CoV-2病毒流程圖

NGS測(cè)序法

NGS測(cè)序法常用的原理是橋式PCR擴(kuò)增，通過(guò)模板DNA分子的化學(xué)修飾，將其錨定在納米孔或者微載體芯片上，利用堿基互補(bǔ)配對(duì)原則，通過(guò)采集熒光標(biāo)記信號(hào)或化學(xué)反應(yīng)信號(hào)，實(shí)現(xiàn)堿基序列的解讀。NGS一次性可完成幾十萬(wàn)至幾百萬(wàn)條序列的測(cè)定，可在基因組水平對(duì)未知病毒進(jìn)行從頭測(cè)序，獲得病原體的基因序列。與RT-PCR相比，NGS可以提供更多的病毒序列和分型信息，是識(shí)別未知病原體的有力工具。

圖3 NGS測(cè)序法檢測(cè)病毒流程圖

CRISPR檢測(cè)法

CRISPR檢測(cè)法的診斷機(jī)制與基因編輯相似，在sgRNA的引導(dǎo)下，CRISPR-Cas蛋白識(shí)別靶標(biāo)序列后，Cas12a、Cas13a和Cas14a內(nèi)切酶被激活，對(duì)靶標(biāo)核酸進(jìn)行切割，產(chǎn)生熒光信號(hào)，達(dá)到檢測(cè)目的。相對(duì)于qPCR等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)而言，CRIPSR檢測(cè)技術(shù)采取等溫?cái)U(kuò)增與Cas酶的反式切割結(jié)合的方法進(jìn)行檢測(cè)，借助sgRNA的特異性識(shí)別，即提高等溫?cái)U(kuò)增后的特異性，又實(shí)現(xiàn)了現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)（POCT）。CRISPR診斷方法被稱(chēng)為下一代分子診斷技術(shù)，有望引起體外診斷領(lǐng)域的新變革。

圖4 CRISPR-Cas12a系統(tǒng)檢測(cè)病毒流程圖

如何選擇檢測(cè)方法？

泓迅生物

引物探針設(shè)計(jì)與合成

無(wú)論選擇哪種檢測(cè)方法，都離不開(kāi)核心原材料引物探針，高質(zhì)量的特異性引物探針可大大提高實(shí)驗(yàn)效率、檢測(cè)準(zhǔn)確性。泓迅生物為您提供高質(zhì)量引物探針設(shè)計(jì)與合成！精準(zhǔn)的引物探針設(shè)計(jì)，先進(jìn)的制造工藝和高效的交付周期，助您迅速開(kāi)展病原體檢測(cè)。我們提供qPCR探針、FISH探針、分子信標(biāo)探針、NGS等不同類(lèi)型的核酸探針，還可為您提供定制化引物探針設(shè)計(jì)與合成服務(wù)，滿足您在分子診斷領(lǐng)域的各種應(yīng)用需求。

 圖5三種探針示意圖

泓迅案例

引物合成是由單個(gè)堿基順次連接合成。每處堿基的合成需要完成脫保護(hù)、縮合連接、乙?；忾]、氧化穩(wěn)定四個(gè)步驟，加之化學(xué)反應(yīng)自身的效率問(wèn)題，最終會(huì)導(dǎo)致引物產(chǎn)物無(wú)法達(dá)到100%的純度。所以，化學(xué)合成的效率直接影響粗產(chǎn)物的純度，同時(shí)也限制了合成引物的長(zhǎng)度（一般超過(guò)150nt的引物推薦使用基因合成或其它分子生物學(xué)的方法制備）。

泓迅生物升級(jí)純化工藝，優(yōu)化試劑配比，最大限度的分離小分子熒光、失敗的小分子片段和目標(biāo)產(chǎn)物，我們的引物探針產(chǎn)品純化效果優(yōu)于市場(chǎng)平均水平，最高純度可達(dá)98%。

常規(guī)純化后的探針產(chǎn)物	泓迅升級(jí)純化工藝后的探針產(chǎn)物

質(zhì)檢結(jié)果顯示，泓迅生物制備的高質(zhì)量探針，MS檢測(cè)于理論分子量相同且無(wú)N±峰，HPLC檢測(cè)純度高達(dá)98%以上，熒光全波長(zhǎng)掃描與對(duì)應(yīng)參數(shù)一致。

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