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合成生物學(xué)底盤細(xì)胞之畢赤酵母
發(fā)布時(shí)間:2024-12-13


酵母表達(dá)系統(tǒng)是真核表達(dá)系統(tǒng)中應(yīng)用最廣泛的之一,其中巴斯德畢赤酵母(Komagataella phaffii,又名Pichia pastoris作為甲基營(yíng)養(yǎng)型酵母的代表,近年來(lái)發(fā)展迅速,應(yīng)用廣泛。


畢赤酵母:基因表達(dá)的新紀(jì)元

畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)誕生于上世紀(jì)80 年代初期,它融合了原核表達(dá)系統(tǒng)與真核表達(dá)系統(tǒng)的諸多優(yōu)點(diǎn),迅速在眾多表達(dá)系統(tǒng)中脫穎而出。與原核表達(dá)系統(tǒng)相比,它不僅保留了操作簡(jiǎn)易、易于培養(yǎng)、生長(zhǎng)速度快、表達(dá)量高、成本低等特性,還具備原核生物所欠缺的對(duì)外源蛋白的翻譯后修飾能力,如糖基化、蛋白磷酸化等,使表達(dá)的重組蛋白更接近天然產(chǎn)物。同時(shí),它又克服了釀酒酵母分泌效率差、表達(dá)菌株不穩(wěn)定、表達(dá)質(zhì)粒易丟失等缺陷,成為外源蛋白表達(dá)的理想選擇。


畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)的主要優(yōu)勢(shì)

1. 高效AOX1啟動(dòng)子:目前最強(qiáng)、調(diào)控機(jī)制最嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膯?dòng)子之一,便于調(diào)控外源基因的表達(dá)。

2. 蛋白加工修飾功能:可對(duì)表達(dá)的外源蛋白進(jìn)行糖基化、磷酸化、脂類?;确g后修飾,使重組蛋白與天然產(chǎn)物更相似。

3. 低成本與高效生長(zhǎng):菌株生長(zhǎng)迅速,培養(yǎng)基成本低廉,培養(yǎng)條件簡(jiǎn)單。

4. 高表達(dá)量:外源蛋白表達(dá)量高,支持胞內(nèi)和分泌表達(dá)。

5. 基因穩(wěn)定整合:外源基因能在基因組的特定位點(diǎn)以單拷貝或多拷貝形式穩(wěn)定整合,可穩(wěn)定遺傳50代以上。

6. 高密度發(fā)酵:耐受高密度發(fā)酵,便于工業(yè)化生產(chǎn)。


 

P. pastoris生產(chǎn)重組蛋白的流程

 

畢赤酵母菌株多樣性

當(dāng)前所采用的巴斯德畢赤酵母菌株都源自原始的Y-11430菌,常用的有GS115、KM71、X33和SMD1168等。蛋白胞內(nèi)表達(dá)優(yōu)先選MutS表型,分泌表達(dá)Mut + 和MutS均可;多數(shù)菌株如SMD1168、GS115、KM-71是組氨酸脫氫酶缺陷型,可用不含組氨酸培養(yǎng)基篩選重組子,且SMD1168為蛋白酶缺陷型,適合表達(dá)不穩(wěn)定蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)復(fù)合物以避免內(nèi)源性蛋白酶降解。但SMD1168菌株生長(zhǎng)緩慢,導(dǎo)致蛋白質(zhì)產(chǎn)量低

菌株

基因型

表型

應(yīng)用

X33

野生型

Mut+ His+

篩選Zeocin抗性表達(dá)載體

GS115

his4

Mut+ His-

篩選含HIS4的表達(dá)載體

KM71

his4 arg4 aox1?::ARG4

MutS His-

篩選含HIS4的表達(dá)載體

KM71H

aox1::ARG4

arg4

MutS His+

篩選Zeocin抗生素抗性的表達(dá)載體

SMD1168

his4 pep4

Mut+ His+

在無(wú)蛋白酶A活性的酵母菌株中

篩選含HIS4的表達(dá)載體

SMD1168H

pep4

Mut+

在無(wú)蛋白酶A活性的酵母菌株中篩選Zeocin抗生素表達(dá)載體

 

畢赤酵母常用表達(dá)載體

畢赤酵母表達(dá)載體分為分泌型和非分泌型兩大類,分別適用于不同類型的蛋白質(zhì)生產(chǎn)需求,其中分泌型載體利用釀酒酵母的分泌信號(hào)序列,有效引導(dǎo)外源蛋白的分泌,提高了蛋白的產(chǎn)量和純度。因此,深入了解和優(yōu)化畢赤酵母表達(dá)載體,對(duì)于提升蛋白生產(chǎn)效率和質(zhì)量至關(guān)重要,也是當(dāng)前生物技術(shù)和基因工程研究中的熱點(diǎn)之一。

表達(dá)載體

標(biāo)志基因

菌株

重組蛋白

pPIC9K

His4, Kan, Amp

GS115

Xylanase

GS115

Porcine circovirus type 2

GS115

Endo‐1,3(4)‐b‐d‐glucanase

GS115

Staphylokinase

pPICZα

Shble

SMD1168

Human chitinase

GS115

Human topoisomerase I

GS115

Human interferon gamma

X‐33

C‐reactive protein

SuperMan5

Insulin

X‐33

Human RNase4

pHIL‐S1

His4, Amp

GS115

Rabies virus glycoprotein

GS115

Rhizopus oryzae Lipase

KM71

Camel lactoferricin

pGAPZα

Shble

GS115

Acyl homoserine lactonase

SMD1168

Variable lymphocyte receptor B

X‐33

Human gastric lipase

pJL‐SX

FLD1, Amp

MS105

Formaldehyde dehydrogenase

pBLHIS‐SX

His4, Amp

JC100

Leukocyte protease inhibitor

常見(jiàn)的用于生產(chǎn)分泌蛋白的畢赤酵母表達(dá)載體【1】

 

表達(dá)載體

標(biāo)志基因

菌株

重組蛋白

pPIC3.5K

His4, Kan, Amp

KM71

Maltooligosyltrehalose synthase

SMD1168

Camellia sinensis heat shock protein

GS115

Pleurotus ostreatus laccases

GS115

Rhizopus oryzae Lipase

GS115

HSA/GH fusion protein

pPICZ

Shble

X‐33

Aquaporin

KM71

Membrane protein

KM71

Dengue virus envelope glycoprotein

pHIL‐D2

His4, Amp

GS115

Prostaglandin H synthase‐2

GS115

CatA1 and SODC

KM71

Rhodococcus nitrile hydratase

GS115

Feline serum albumin

pGAPZ

GS115

GTPase RabA4c

GS115

Xylose isomerase

GS115

β‐Galactosidase

pJL‐IX

FLD1, Amp

MS105

Formaldehyde dehydrogenase

pBLHIS‐IX

His4, Amp

KM71

L1‐L2 proteins of HPV virus type 16

常見(jiàn)的用于生產(chǎn)胞內(nèi)蛋白的畢赤酵母表達(dá)載體【1】

 

畢赤酵母基因改造技術(shù)

1. 基于線性化質(zhì)粒載體的同源重組

同源重組技術(shù)是一種利用生物體自身修復(fù)機(jī)制的基因工程技術(shù)。在畢赤酵母中,通過(guò)將線性化的質(zhì)粒載體引入,可以高效地將外源基因整合到宿主基因組的特定位點(diǎn)。這一過(guò)程依賴于同源臂序列,這些序列與目標(biāo)基因組區(qū)域具有高度相似性,從而促進(jìn)了質(zhì)粒載體與宿主DNA之間的重組。這種方法的優(yōu)勢(shì)在于其操作簡(jiǎn)便、整合效率高,可以實(shí)現(xiàn)外源基因的多拷貝插入,這對(duì)于提高基因表達(dá)水平和蛋白質(zhì)產(chǎn)量至關(guān)重要。在工業(yè)生產(chǎn)中,這種技術(shù)常被用于優(yōu)化基因表達(dá),以滿足生物制藥和工業(yè)酶生產(chǎn)的需求。此外,同源重組技術(shù)還可以用于基因功能研究、疾病模型構(gòu)建以及生物技術(shù)產(chǎn)品的開(kāi)發(fā)。


2. 基于CRISPR/Cas9的基因編輯

CRISPR/Cas9系統(tǒng)是一種革命性的基因編輯技術(shù),它通過(guò)利用指導(dǎo)RNA(gRNA)引導(dǎo)核酸酶Cas9精確切割目標(biāo)DNA序列。這種特異性的切割觸發(fā)了細(xì)胞內(nèi)的修復(fù)機(jī)制,包括非同源末端連接(NHEJ)和同源定向修復(fù)(HDR),從而實(shí)現(xiàn)基因的敲除、插入或替換。CRISPR/Cas9技術(shù)以其高效性和精準(zhǔn)性在基因組編輯領(lǐng)域占據(jù)重要地位,特別適用于復(fù)雜代謝途徑的優(yōu)化和多基因編輯。在畢赤酵母中,CRISPR/Cas9技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于基因功能研究、菌株改良以及生產(chǎn)性能的提升。例如,通過(guò)敲除或替換特定基因,可以增強(qiáng)宿主菌的蛋白質(zhì)表達(dá)能力或改變其代謝特性,以適應(yīng)特定的工業(yè)生產(chǎn)需求。


3. 基于CRISPR/Cas12的基因編輯

CRISPR/Cas12系統(tǒng),也稱為Cpf1,是CRISPR家族中的另一種基因編輯工具。Cas12蛋白具有廣泛的靶向能力和單鏈DNA切割特性,使其在基因組編輯中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。與Cas9相比,Cas12對(duì)靶位點(diǎn)的PAM(原始間隔短回文重復(fù)序列)依賴性更寬松,這為基因編輯提供了更大的靈活性。CRISPR/Cas12系統(tǒng)在表觀遺傳調(diào)控和新型生物技術(shù)的開(kāi)發(fā)中展現(xiàn)出巨大潛力,例如,它可以用于研究基因沉默、激活以及DNA甲基化等表觀遺傳修飾。此外,Cas12的單鏈切割特性使其在開(kāi)發(fā)新型核酸檢測(cè)技術(shù)、基因治療策略以及合成生物學(xué)應(yīng)用中具有獨(dú)特的應(yīng)用前景。在畢赤酵母中,CRISPR/Cas12技術(shù)的應(yīng)用還相對(duì)較新,但已有研究表明,它在基因組編輯和基因功能研究中具有巨大的潛力。

 

畢赤酵母創(chuàng)新突破

經(jīng)過(guò)幾十年的廣泛應(yīng)用,畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)已成功表達(dá)了數(shù)以千計(jì)的異源蛋白,其中大部分為醫(yī)藥制品。美國(guó)FDA 對(duì)該系統(tǒng)的認(rèn)可,如 Cephelon 制劑的獲批,充分證明了其安全性和有效性。在我國(guó),雖然目前上市的基因工程藥物大多源于大腸桿菌原核表達(dá)系統(tǒng),但畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)憑借其國(guó)際上的廣泛認(rèn)可,必將在未來(lái)的醫(yī)藥市場(chǎng)中占據(jù)重要地位。

 

泓迅生物

酵母基因編輯 & 重組蛋白表達(dá)平臺(tái)

泓迅生物利用CRISPR等新技術(shù),實(shí)現(xiàn)了對(duì)畢赤酵母基因組的精準(zhǔn)編輯,包括基因敲除、插入和替換。我們成功敲除了GS115菌株的KU70基因,顯著提高了畢赤酵母的重組效率和外源基因的整合頻率,同時(shí)敲除了pep4基因,降低了外源蛋白被降解的風(fēng)險(xiǎn)。

我們深耕合成生物學(xué)領(lǐng)域,擁有豐富的基因合成、重組蛋白表達(dá)和基因編輯經(jīng)驗(yàn)。我們提供一站式解決方案,幫助解決畢赤酵母蛋白表達(dá)和基因改造的需求,最大限度縮短研發(fā)周期。

 

》案例展示

通過(guò)對(duì)畢赤酵母GS115的基因改造,提高了菌株對(duì)外源蛋白的表達(dá)和分泌。并利用該重組菌株成功表達(dá)了多個(gè)人源重組蛋白的高效分泌表達(dá),培養(yǎng)液中雜蛋白很少,產(chǎn)量預(yù)計(jì)可達(dá)10g/L。

 



 

》免費(fèi)樣品測(cè)試

· 可免費(fèi)提供少量蛋白樣品以供測(cè)試。

· 菌株、蛋白等相關(guān)信息可聯(lián)系本司咨詢。

 

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未來(lái)展望

畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)以其高表達(dá)、高密度、多樣化翻譯后修飾以及無(wú)內(nèi)毒素和病毒的安全性等優(yōu)勢(shì),成為重組蛋白表達(dá)的優(yōu)選平臺(tái)。CRISPR/Cas9等基因組編輯技術(shù)的應(yīng)用將進(jìn)一步推動(dòng)該系統(tǒng)的發(fā)展,助力重組人源蛋白在生物醫(yī)藥、美容護(hù)膚等領(lǐng)域的研究和應(yīng)用。

重組膠原蛋白基因的選擇和設(shè)計(jì)、表達(dá)條件的優(yōu)化和驗(yàn)證對(duì)于獲得高產(chǎn)量的蛋白至關(guān)重要。泓迅生物提供從“序列優(yōu)化”到“基因合成”到“重組膠原蛋白表達(dá)”一站式服務(wù)。高效的基因合成、多種表達(dá)體系協(xié)助您在實(shí)驗(yàn)室低成本無(wú)限合成,提高膠原蛋白的表達(dá)量、親水性和可加工性,創(chuàng)造更多應(yīng)用可能。

 

參考文獻(xiàn)

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